Monkeypox a muté à un rythme sans précédent avec une « évolution accélérée ».

Les chercheurs qui étudient la constitution génétique du virus de la variole du singe ont déclaré que le virus semble avoir muté largement, bien plus que ce à quoi on pourrait normalement s’attendre.

Les travaux ont été détaillés dans une nouvelle étude publiée dans la revue la naturopathie. Dans le cadre de l’étude, des chercheurs portugais ont collecté un total de 15 séquences de virus monkeypox – principalement du Portugal – et ont reconstruit leurs données génétiques.

La variole du singe est une maladie rare dont on pense qu’elle est d’origine animale. Il appartient à la même famille de virus que la variole. Habituellement, le monkeypox est localisé dans les pays d’Afrique occidentale et centrale, mais cette année a vu la première épidémie dans plusieurs pays, y compris des cas sans lien connu avec l’Afrique occidentale ou centrale, avec plus de 3 500 cas signalés jeudi, selon les Centers for Disease des États-Unis. Contrôle et Prévention (CDC).

Le virus peut être transmis entre les personnes par contact étroit avec des lésions, des fluides corporels, des gouttelettes respiratoires – comme un contact direct – et des matériaux contaminés. L’épidémie actuelle a créé une incertitude quant à la manière exacte dont le virus se propage, avec beaucoup plus de transmissions que la normale.

Dans la dernière étude, les chercheurs ont découvert environ 50 variations génétiques dans les virus qu’ils ont étudiés par rapport à ceux de 2018 et 2019. C’est « bien plus que ce à quoi on s’attendrait compte tenu des estimations précédentes » du taux de mutation des orthopoxvirus, y compris le monkeypox un type – entre six et douze fois plus.

Ces variations génétiques importantes pourraient indiquer une « évolution accélérée ».

« Nos données révèlent des indices supplémentaires sur l’évolution virale en cours et une éventuelle adaptation humaine », a écrit l’équipe, ajoutant qu’elle avait identifié des protéines connues pour interagir avec le système immunitaire humain. Cependant, d’autres études sont nécessaires pour en savoir plus sur le rôle potentiel qu’elles pourraient jouer dans l’adaptation du virus monkeypox à la propagation humaine.

João Paulo Gomes, chef de l’unité de génomique et de bioinformatique des Instituts nationaux de la santé au Portugal, co-auteur de l’étude, a déclaré qu’on ne sait pas si les mutations ont contribué à une transmissibilité accrue entre les personnes.

« Nous ne savons pas », a-t-il dit semaine de nouvelles. « Tout ce que nous savons, c’est que ces 50 mutations supplémentaires étaient assez inattendues.

« Considérant que ce virus monkeypox de 2022 est probablement un descendant du virus de l’épidémie de 2017 au Nigeria, on ne s’attendrait pas à plus de cinq à dix mutations supplémentaires au lieu de la cinquantaine de mutations observées. Nous espérons que des groupes spécialisés mèneront désormais des expériences en laboratoire pour comprendre si ce virus de 2022 a augmenté sa transmissibilité. »

Une autre découverte notable de l’étude est que la plupart des mutations sont d’un type spécifique qui peut avoir été introduit par un mécanisme de défense humain appelé APOBEC3, qui fonctionne en introduisant des mutations dans les virus pour les empêcher de fonctionner correctement, a déclaré Pam Vallely. Professeur de virologie médicale à l’Université de Manchester.

« Cependant, dans ce cas, les mutations ne semblent pas rendre le virus incapable de viabilité et peuvent l’aider à s’adapter à la transmission interhumaine », a déclaré Vallely, qui n’a pas participé à l’étude. semaine de nouvelles. « Ce n’est qu’une théorie qui correspond aux preuves actuelles, et beaucoup plus de travail sera nécessaire pour voir si cela se produit vraiment. Je ne pense pas qu’on puisse dire que les mutations l’ont rendu plus contagieux, mais peut-être qu’ils l’ont rendu mieux adapté aux humains. »

Les chercheurs affirment que leurs travaux montrent que le séquençage du génome viral du monkeypox pourrait être suffisamment précis pour suivre la propagation de l’épidémie actuelle et voir comment la transmission pourrait changer. Ceci, à son tour, permettrait aux décideurs d’introduire des mesures pour freiner la propagation du monkeypox. Les vaccins sont déjà disponibles.

Jeremy Kamil, professeur agrégé de microbiologie et d’immunologie à la Louisiana State University Health Shreveport, a déclaré semaine de nouvelles a qualifié l’étude de « très impressionnante », mais a déclaré qu’il était trop tôt pour dire avec certitude si la variole du singe évolue rapidement jusqu’à ce que nous puissions exclure la possibilité que le virus ait duré « plus longtemps que prévu – peut-être initialement – circule chez l’homme et s’adapte dans régions sous-évaluées du monde, telles que certaines parties de l’Afrique où la variole du singe est endémique. »

Alex Sigal, virologue à l’Institut africain de recherche en santé (AHRI) et professeur agrégé à l’Université du KwaZulu-Natal, qui n’a pas non plus participé à l’étude, a fait écho au point de Kamil.

« Je pense que cette épidémie est sous le radar depuis un certain temps », a-t-il déclaré. semaine de nouvelles. « Certes, la diminution de l’immunité parce que le vaccin contre la variole n’est plus administré aurait aidé.

« [The findings are] inquiétant, mais nous verrons si ce virus continue de se propager une fois que les gens auront pris conscience des signes et qu’il éclatera dans la population générale. Cela dépend du contact, et à moins que la propagation ne soit respiratoire, il devrait être plus facile de l’arrêter. »

Les efforts de séquençage des virus ont également confirmé que les virus examinés appartenaient à un type spécifique de virus monkeypox connu sous le nom de clade 3, confirmant qu’ils font partie du type ouest-africain plus large par opposition au type centrafricain.

La version ouest-africaine du monkeypox, avec un taux de mortalité généralement inférieur à 1%, est beaucoup moins virulente que la version centrafricaine du clade 1, qui peut entraîner la mort dans plus de 10% des cas, selon l’étude.

Mise à jour 24/06/22 06h13 HE : Cet article a été mis à jour avec les derniers numéros de cas de monkeypox.