Échappement de la neutralisation par les sous-variants SARS-CoV-2 omicron BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 |  NEJM

Échappement de la neutralisation par les sous-variants SARS-CoV-2 omicron BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 | NEJM

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À propos de l’éditeur :

Mutations sous-variantes d’Omicron et réponses d’anticorps neutralisants.

Le panneau A montre la lignée de mutation identifiée dans les sous-variants Omicron BA.1, BA.2, BA.2.12.1 et BA.4 ou BA.5 du SRAS-CoV-2 par rapport à l’isolat de référence WA1/2020. BA.4 et BA.5 ont des séquences de protéines de pointe identiques et ont donc été regroupés. FP désigne le peptide de fusion, la répétition heptade HR1 1, la répétition heptade HR2 2, le domaine N-terminal NTD, le domaine de liaison au récepteur RBD, le motif de liaison au récepteur RBM, le sous-domaine SD1 1 et le sous-domaine SD2 2. Le panneau B montre les titres d’anticorps neutralisants tels que déterminés par la luciférase- basés sur des tests de neutralisation de pseudovirus dans des échantillons obtenus de 27 participants 6 mois après avoir reçu la série de vaccins à ARN messager BNT162b2 à deux doses et 2 semaines après la troisième dose (de rappel). Le panneau C montre les titres d’anticorps neutralisants chez les participants infectés par la sous-variante BA.1 ou BA.2. Tous les participants infectés avaient été vaccinés à l’exception d’un participant qui avait un titre d’anticorps neutralisant négatif. Deux ou trois points de temps après l’infection sont indiqués pour 9 participants. Les titres d’anticorps neutralisants ont été mesurés par rapport à l’isolat de référence SARS-CoV-2 WA1/2020 et aux sous-variants omicron BA.1, BA.2, BA.2.12.1 et BA.4 ou BA.5. Dans les panneaux B et C, les médianes (barres noires) sont présentées numériquement et les différences de facteurs par rapport aux autres sous-variantes sont indiquées ; la ligne horizontale en pointillés indique la limite inférieure de détection pour le test.

Plusieurs souches du variant Omicron (B.1.1.529) du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) avec syndrome respiratoire aigu sévère sont apparues ces derniers mois,1 avec les sous-variants BA.1 et BA.2 montrant une fuite significative d’anticorps neutralisants.2-5 La sous-variante BA.2.12.1 est maintenant la souche dominante aux États-Unis, et BA.4 et BA.5 sont dominantes en Afrique du Sud (Figure 1A). Les sous-variants BA.4 et BA.5 ont des séquences de protéines de pointe identiques.

Nous avons évalué les titres d’anticorps neutralisants contre l’isolat de référence SARS-CoV-2 WA1/2020 avec les sous-variants omicron BA.1, BA.2, BA.2.12.1 et BA.4 ou BA.5 chez 27 participants qui avaient été vaccinés et boostés avec le vaccin à ARN messager BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) et chez 27 participants infectés par la sous-variante BA.1 ou BA.2 il y a une médiane de 29 jours (plage de 2 à 113) (tableaux S1 et S2 dans l’annexe supplémentaire, disponible avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org). Dans la cohorte de vaccination, les participants ont été exclus s’ils avaient des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 ou un résultat positif à l’analyse sérologique de la nucléocapside, ou s’ils utilisaient un autre vaccin contre la maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) ou un immunosuppresseur avaient reçu un médicament .

Six mois après les deux premières immunisations au BNT162b2, le titre moyen d’anticorps neutralisants du pseudovirus était de 124 contre WA1/2020 mais de moins de 20 contre tous les sous-variants omicron testés (Figure 1B). Deux semaines après l’administration de la dose de rappel, le titre moyen d’anticorps neutralisants a augmenté significativement à 5783 contre l’isolat WA1/2020, 900 contre le sous-variant BA.1, 829 contre le sous-variant BA.2, 410 contre le sous-variant BA.2.12.1 et 275 contre la sous-variante BA.4 ou BA.5. Ces données montrent que par rapport à la réponse contre l’isolat WA1/2020, le titre d’anticorps neutralisants était 6,4 fois plus faible contre BA.1, 7,0 fois contre BA.2, 14,1 fois contre BA. 2.12.1, et par un facteur de 21,0 par rapport à BA.4 ou BA.5. De plus, par rapport au titre moyen d’anticorps neutralisants contre le sous-variant BA.1, le titre moyen était 2,2 fois plus faible contre le sous-variant BA.2.12.1 et 3,3 fois plus faible contre le sous-variant BA.4 ou BA. 5 sous-variante.

Parmi les participants qui avaient été infectés par la sous-variante BA.1 ou BA.2 d’omicron, tous sauf un avaient été vaccinés contre le Covid-19. En raison de la variabilité de la collecte d’échantillons après le début de l’infection, certains échantillons peuvent ne pas refléter les titres d’anticorps neutralisants maximaux (tableau S2). Parmi les participants ayant des antécédents de Covid-19, le titre moyen d’anticorps neutralisants était de 11 050 contre l’isolat WA1/2020, 1 740 contre la sous-variante BA.1, 1 910 contre la sous-variante BA.2, 1 150 contre la sous-variante BA.2.12.1 , et 590 contre la sous-variante BA.4 ou BA.5 (Illustration 1C). Ces données montrent que par rapport à l’isolat WA1/2020, le titre moyen d’anticorps neutralisants était 6,4 fois plus faible contre BA.1, 5,8 fois contre BA.2, 9,6 fois contre BA.2.12. 1 et d’un facteur 18,7 par rapport à BA.4 ou BA.5. De plus, par rapport aux titres médians contre la sous-variante BA.1, le titre médian était inférieur d’un facteur 1,5 par rapport à la sous-variante BA.2.12.1 et inférieur d’un facteur 2,9 par rapport à la sous-variante BA.4 ou BA.5.

Ces données indiquent que les sous-variantes BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 échappent essentiellement aux anticorps neutralisants induits à la fois par la vaccination et l’infection. De plus, les titres d’anticorps neutralisants contre le sous-variant BA.4 ou BA.5 et (dans une moindre mesure) contre le sous-variant BA.2.12.1 étaient inférieurs aux titres contre les sous-variants BA.1 et BA.2, suggérant que le SARS-CoV La variante -2 omicron a évolué avec l’augmentation de l’échappement de neutralisation. Ces résultats fournissent un contexte immunologique pour les poussées actuelles causées par les sous-variants BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 dans les populations à fréquence de vaccination élevée avec une infection BA.1 ou BA.2.

Nicole P. Hachmann, BS
Jessica Miller, BS
Ai-ris Y. Collier, M.D.
John D. Ventura, Ph.D.
Jingyou Yu, Ph.D.
Marjorie Rowe, BS
Esther A Bondzie, MSN
Olivia Powers, BS
Nehalee Surve, MS
Kevin Hall, BS
Dan H. Barouch, MD, Ph.D.
Centre médical Beth Israel Deaconess, Boston, MA
[email protected]

Soutenu par une subvention (CA260476) du Institut national de la santé (NIH), par le Consortium du Massachusetts pour la préparation aux agents pathogèneset à travers le Institut Ragon. docteur Barouch est soutenu par le Fondation Musc. docteur Collier est soutenu par le programme de développement des scientifiques de la reproduction Eunice Kennedy Shriver Institut national pour la santé de l’enfant et le développement humainpar une subvention (HD000849) du Burroughs Wellcome Fund et par une subvention (AI69309) du NIH.

Les formulaires de divulgation fournis par les auteurs avec le texte intégral de cette lettre sont disponibles sur NEJM.org.

Cette lettre a été publiée le 22 juin 2022 sur NEJM.org.

  1. 1. Viana R, Moyo S, Amoako DG, et coll. Propagation épidémique rapide du variant omicron du SRAS-CoV-2 en Afrique australe. La nature 2022;603 :679686.

  2. 2. Célé S, Jackson L., Khoury DS, et coll. Omicron échappe largement, mais incomplètement, à la neutralisation par Pfizer BNT162b2. La nature 2022;602 :654656.

  3. 3. Liu L., Iketani S, Guo Y, et coll. Vol d’anticorps remarquable manifesté par la variante omicron du SRAS-CoV-2. La nature 2022;602 :676681.

  4. 4. YuJ, Collier AY, Rowe M, et coll. Neutralisation des variants SARS-CoV-2 omicron BA.1 et BA.2. N anglais J méd 2022;386 :15791580.

  5. 5. Iketani S, Liu L., Guo Y, et coll. Propriétés d’évasion des anticorps des sous-lignées SARS-CoV-2 omicron. La nature 2022;604 :553556.

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